ご質問有難う御座います。
瓦屋根から金属製の屋根に葺き替えた場合、屋根材の重量が約10分の1になり、建物に掛かる荷重が減ります。建て付けが悪くなるというのは、今まで上から抑えられていた重さから解放されるので、建物が動く事を言っているのだと思います。ですが、殆ど影響は無いでしょう。
屋根が軽くなった為に起こる建物の影響は、建て付けを悪くするほどは現れませんので、心配はいりません。もし仮に建て付けが悪くなったとしても、それは木材が本来の形に戻った事を意味しますので、多少の建具調整で十分対応しきれます。
建て付けが悪くなるよりも、地震の時の揺れが軽減されるメリットの方が大きいですから、瓦屋根から金属屋根への葺替えをお薦めします。